ДЕНЬ ДЕВЯТЫЙ. ЧТО ТАКОЕ GWAS И ГДЕ ОН ОБИТАЕТ

ДЕНЬ ДЕВЯТЫЙ. ЧТО ТАКОЕ GWAS И ГДЕ ОН ОБИТАЕТ

💫Продолжение реалити-сериала😄

Мы продолжаем знакомить вас с «путевыми заметками» наших студенток. Напомним, 6 студенток факультета естествознания АГУ — Влада Белоконева, Татьяна Коваленко, Диана Ошуркова, Екатерина Постникова, Арина Черненченко, Юлия Шуликина — в настоящее время проходят обучение в рамках образовательного модуля по генетике в университете «Сириус».

💬 Небесная канцелярия продолжает радовать нас не только солнечными ваннами, но и повышением температуры воздуха! В Сочи пришла настоящая весна!

Мы полностью вошли в рабочий ритм, сегодня наш день состоял из теоретического блока лекций и практического блока лабораторных работ.

Познакомились с новыми преподавателями: Натальей Альбертовной Швачко — научным сотрудником Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова, Маргаритой Афанасьевной Вишняковой – доктором биологических наук, главным научным сотрудником Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова.

Наталья Альбертовна рассказала нам о методах современной генетики количественных признаков, а Маргарита Афанасьевна представила лекцию, посвящённую доместикации и центрам происхождения культурных растений.

После обеда мы отправились «на лабы» — творить науку — под руководством преподавателя, кандидата биологических наук Игоря Васильевича Тоцкого. Тематика сегодняшних лабораторных звучала так: «Выявление локусов количественных признаков, полногеномный анализ ассоциаций».

Да-да, только сейчас мы подошли к тому, что же такое GWAS. Несмотря на сложное название, все предельно просто.

Полногеномный поиск ассоциаций (англ. genome-wide association studies, GWA study, GWAS) — направление биологических исследований, связанных с исследованием ассоциаций между геномными вариантами и фенотипическими признаками.

Для чего это нужно? Например, можно узнать о предрасположенности к заболеванию, выявить биологические основы восприимчивости к болезни. На основе полученной информации можно разработать новую стратегию профилактики и лечения.

Сегодняшний анализ мы проводили с помощью программы Tassel-5. Работа была немного сложной и непривычной: от огромных объемов данных и длинных чисел буквально рябило в глазах. Но мы справились и получили новый и очень ценный опыт работы. Игорь Васильевич грамотно и доходчиво объяснил нам правила работы и указал на допущенные ошибки. Так что, когда пришла пора самим составить график, мы справились быстро и без каких-то серьезных затруднений.

Ура! Завтра будем штурмовать новые вершины знаний!